nbsprotВестник войск РХБ защитыJournal of NBC Protection Corps2587-57283034-279127 Научный центр10.35825/2587-5728-2023-7-4-338-349nbsprot-331Research ArticleБиологическая безопасность и защита от биологических угрозBiological Security and Protection against Biological ThreatsСублинии геноварианта «омикрон» вируса SARS-CoV-2 как потенциальные доминирующие агенты новых подъемов заболеваемости COVID-19 в РоссииSublines of Omicron Genovariant of SARS-CoV-2 Virus as Potential Dominant Agents of New Rises of COVID-19 Morbidity in Russiahttps://orcid.org/0000-0002-1817-0126СизиковаТ. Е.SizikovaT. E.

Сизикова Татьяна Евгеньевна - Старший научный сотрудник, канд. биол. наук

141306, Московская обл., г. Сергиев Посад-6, ул. Октябрьская, д. 11

Tatyana E. Sizikova - Leading Researcher. Cand. Sci. (Biol.)

Oktyabrskaya St, 11, Sergiev Posad 141306

48cnii@mil.ruКарулинаН. В.KarulinaN. V.

Карулина Наталья Васильевна - Старший научный сотрудник, канд. биол. наук

141306, Московская обл., г. Сергиев Посад-6, ул. Октябрьская, д. 11

Nataliya V. Karulina - Leading Researcher. Cand. Sci. (Biol.)

Oktyabrskaya St, 11, Sergiev Posad 141306

48cnii@mil.ruПетровА. А.PetrovA. A.

Петров Александр Анатольевич - Начальник научно-исследовательского управления, д-р мед.наук

141306, Московская обл., г. Сергиев Посад-6, ул. Октябрьская, д. 11

Aleksandr A. Petrov - Head of Research Department, Dr Sci. (Med.)

Oktyabrskaya St, 11, Sergiev Posad 141306

48cnii@mil.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7674-2321ЛебедевВ. Н.LebedevV. N.

Лебедев Виталий Николаевич - Ведущий научный сотрудник, д-р биол. наук 

141306, Московская обл., г. Сергиев Посад-6, ул. Октябрьская, д. 11

Vitaliy N. Lebedev - Senior Researcher. Dr Sci. (Biol.)

Oktyabrskaya St, 11, Sergiev Posad 141306

48cnii@mil.ruhttps://orcid.org/0000-0002-6742-3919БорисевичС. В.BorisevichS. V.

Борисевич Сергей Владимирович - Начальник ФГБУ «48 ЦНИИ» Минобороны России, д-р биол. наук, профессор, академик РАН

141306, Московская обл., г. Сергиев Посад-6, ул. Октябрьская, д. 11

Sergey V. Borisevich - Head of Institute. Dr Sci. (Biol.), Professor, Academician of Russian Academy of Sciences

Oktyabrskaya St, 11, Sergiev Posad 141306

 

48cnii@mil.ruФедеральное государственное бюджетное учреждение «48 Центральный научно-исследовательский институт» Министерства обороныРоссияFederal State Budgetary Institution "48 Central Research Institute" of the Ministry of DefenceRussian Federation20230204202474338349Copyright © Сизикова Т.Е., Карулина Н.В., Петров А.А., Лебедев В.Н., Борисевич С.В., 20242024Сизикова Т.Е., Карулина Н.В., Петров А.А., Лебедев В.Н., Борисевич С.В.Sizikova T.E., Karulina N.V., Petrov A.A., Lebedev V.N., Borisevich S.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.nbsprot.ru/jour/article/view/331

Анализ существующей информации о распространении COVID-19 в России показывает, что одной из ведущих причин возникновения новых подъемов заболеваемости является распространение новых вариантов вируса SARS-CoV-2. Геновариант «омикрон» вируса SARS-CoV-2 стал доминирующим вариантом пятого и последующих подъемов заболеваемости COVID-19 в России. Цель работы – анализ возникающих сублиний геноварианта «омикрон» вируса SARS-CoV-2 как потенциальных ведущих агентов новых подъемов заболеваемости COVID-19 в России. Источниковая база исследования. Данные, опубликованные в отечественных и англоязычных научных изданиях, доступных через сеть Интернет (РИНЦ, PubMed, Google Scholar). Метод исследования – аналитический. Результаты. Вариант «омикрон» (B1.1.529) вируса SARS-CoV-2 был впервые выявлен 22 ноября 2021 г. в ЮАР и Ботсване. Вероятно, что он возник в результате многократных пассажей возбудителя в организме больного с иммуннодефицитным состоянием. В работе рассмотрены основные свойства геноварианта «омикрон» и его сублиний, эпидемические характеристики подъемов заболеваемости COVID-19 в России, вызванных сублиниями геноварианта «омикрон», проведена оценка сублиний геноварианта «омикрон» как потенциальных доминирующих агентов новых подъемов заболеваемости COVID-19 в России. На основании рассмотренных данных показано, что основным направлением эволюции вируса SARS-CoV-2 является появление сублиний геноварианта «омикрон», характеризующихся повышенной трансмиссивностью, но меньшей тяжестью вызываемого заболевания по сравнению с ранее циркулирующими геновариантами возбудителя COVID-19. Основным отличительным признаком новых субвариантов, «Кракен», «Цербер», «Кентавр», «Арктур», «Пирола», геноварианта «омикрон» являются множественные аминокислотные замены в структурном гликопротеине S. Максимальный уровень изменчивости данного структурного белка по сравнению с исходным вариантом B.1.1.529 отмечен для субварианта «Пирола», но только субвариант «Кракен» стал доминирующим агентом подъема заболеваемости COVID-19 в России. Вывод. Новые подъемы заболеваемости COVID-19 в России главным образом будут связаны не с появлением новых субвариантов геноварианта «омикрон», а с сезонным фактором.

The analysis of existing information about invasion of COVID-19 in Russia shows that that one of leading reason of  existing of new rises of covid-19 morbidity is distribution of new genovariants of SARS-CoV-2 virus. The omicron  genovariant of SARS-CoV-2 virus was a dominant agent of fifth and subsequent rises of COVID-19 morbidity in  Russia. The aim of this work – the estimation of sublines of omicron genovariant of SARS-CoV-2 virus as potential  dominant agents of new rises of COVID-19 morbidity in Russia. The source base of the study. Data published in  Russian and English-language scientific publications available via the Internet (RSCI, PubMed, Google Scholar). The  research method is analytical. Results. The basic properties of omicron genovariant of SARS-CoV-2 virus, epidemical  characteristics of the rises of COVID-19 morbidity in Russia, caused by new sublines of omicron variant, estimation  ofsublines of omicron genovariant as potential dominant agent of new rises of COVID-19 morbidity in Russia are  viewed. It is shown that basic direction of SARS-CoV-2 virus evolution is existing of sublines of omicron genovariant,  which are characterized by increased transmissivity but with less severity of the disease caused compared to previously  circulated variants of COVID-19agent. The main distinguishing feature of the new subvariants («Kraken», «Czerber»,  «Centaur», «Arktur», «Pirola») are multiple amino acid exchanges in structural glycoprotein S. The maximum level  of variability of this structural protein compared to the original variant of SARS-CoV-2 virus is marked for Pirola  subvariant. Onle Kraken subvariant was dominant agent of rise of COVID-19 morbidity in Russia. Conclusion. New  rises of COVID-19 morbidity in Russia will not be connected with existing of new subvariants of omicron genovariant,  but only with season factor.

аминокислотные заменывирус SARS-CoV-2генетическая изменчивостьгеновариант «омикрон»коллективный иммунитет«Пирола»субвариантыCOVID-19SARS-CoV-2 virusCOVID-19Omicron genovariantsubvariantgenetic variabilityamino acid exchangesherd immunityФедеральное государственное бюджетное учреждение «48 Центральный научно-исследовательский институт» Министерства обороны Российской ФедерацииFederal State Budgetary Establishment «48 Central Scientific Research Institute» of the Ministry of Defence of the Russian FederationReferencesСизикова ТЕ, Лебедев ВН, Борисевич СВ. Природные, биологические и социальные факторы, способствующие возникновению новых подъемов заболеваемости COVID-19 в Российской Федерации. БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. 2022;22(4):351–60. https://doi.org/10.30895/2221-996X-2022-22-4-351-360Sizikova TE, Lebedev VN, Borisevich SV. Environmental, biological and social factors contributing to new rises in COVID-19 morbidity in Russia. Biological Products. Prevention, Diagnosis, Treatment. 2022;22(4):351–60 (in Russian). https://doi.org/10.30895/2221-996X-2022-22-4-351-360Сизикова ТЕ, Чухраля ОВ, Лебедев ВН, Борисевич СВ. Вариант омикрон вируса SARS-CoV-2: способность вызывать заболевание у лиц, имеющих иммунитет против COVID-19, сформированный в результате вакцинации или ранее перенесенного заболевания. Вестник войск РХБ защиты. 2022;6(1):44–55. https://doi.org/10.35825/2587-5728-2021-6-1-44-55Sizikova TE, Chukhralya OV, Lebedev VN, Borisevich SV. The Omicron Variant of SARS-CoV-2 Virus: the Ability to Cause Disease in Persons with Immunity against COVID-19. Journal of NBC Protection Corps. 2022;6(1):44–55 (in Russian). https://doi.org/10.35825/2587-5728-2021-6-1-44-55Онищенко ГГ, Сизикова ТЕ, Лебедев ВН, Борисевич СВ. Вариант «Омикрон» вируса SARS-CoV-2 как доминантный агент нового подъема заболевания в условиях пандемии COVID-19. Вестник РАН. 2022;92(7):636–46. https://doi.org/10.1134/S1019331622040074Onishchenko GG, Sizikova TE, Lebedev VN, Borisevich SV. The Omicron Variant of the Sars-Cov-2 Virus As the Dominant Agent of a New Risk of Disease amid the COVID-19 Pandemic. Herald Russ Acad Sci. 2022;92(4):381– 91 (in Russian). https://doi.org/10.1134/S1019331622040074Thakur S, Sasi S, Pillai SG, Nag A, Shukla D, Singhal R, et al. SARS-CoV-2 Mutations and Their Impact on Diagnostics, Therapeutics and Vaccines. Front. Med. 2022;9:815389. https://doi.org/10.3389/fmed.2022.815389Thakur S, Sasi S, Pillai SG, Nag A, Shukla D, Singhal R, et al. SARS-CoV-2 Mutations and Their Impact on Diagnostics, Therapeutics and Vaccines. Front. Med. 2022;9:815389. https://doi.org/10.3389/fmed.2022.815389Roemer C, Sheward DJ, Hisner R, Gueli F, Sakaguchi H, Frohberg N, et al. SARS-CoV-2 evolution in the Omicron era. Nat Microbiol. 2023;8:1952–59. https://doi.org/10.1038/s41564-023-01504-wRoemer C, Sheward DJ, Hisner R, Gueli F, Sakaguchi H, Frohberg N, et al. SARS-CoV-2 evolution in the Omicron era. Nat Microbiol. 2023;8:1952–59. https://doi.org/10.1038/s41564-023-01504-wGuo Y, Han J, Zhang Y, He J, Yu W, Zhang X, et al. SARS-CoV-2 Omicron Variant: Epidemiological Features, Biological Characteristics, and Clinical Significance. Front Immunol. 2022;13:877101. https://doi.org/10.3389/fimmu.2022.877101Guo Y, Han J, Zhang Y, He J, Yu W, Zhang X, et al. SARS-CoV-2 Omicron Variant: Epidemiological Features, Biological Characteristics, and Clinical Significance. Front Immunol. 2022;13:877101. https://doi.org/10.3389/fimmu.2022.877101Morris CP, Eldesouki RE, Fall A, Gaston DC, Norton JM, Gallagher ND, et al. SARS-CoV-2 reinfections during the Delta and Omicron waves. JCI Insight. 2022;7(20):e162007. https://doi.org/10.1172/jci.insight.162007Morris CP, Eldesouki RE, Fall A, Gaston DC, Norton JM, Gallagher ND, et al. SARS-CoV-2 reinfections during the Delta and Omicron waves. JCI Insight. 2022;7(20):e162007. https://doi.org/10.1172/jci.insight.162007Zhang J, Chen N, Zhao D, Zhang J, Hu Z, Tao Z. Clinical Characteristics of COVID-19 Patients Infected by the Omicron Variant of SARS-CoV-2. Front Med. 2022;9:912367. https://doi.org/10.3389/fmed.2022.912367Zhang J, Chen N, Zhao D, Zhang J, Hu Z, Tao Z. Clinical Characteristics of COVID-19 Patients Infected by the Omicron Variant of SARS-CoV-2. Front Med. 2022;9:912367. https://doi.org/10.3389/fmed.2022.912367Tanasa IA, Manciuc C, Carauleanu A, Navolan DB, Bohiltea RE, Nemescu D. Anosmia and ageusia associated with coronavirus infection (COVID-19) – what is known? Exp Ther Med. 2020;20(3):2344–7. https://doi.org/10.3892/etm.2020.8808Tanasa IA, Manciuc C, Carauleanu A, Navolan DB, Bohiltea RE, Nemescu D. Anosmia and ageusia associated with coronavirus infection (COVID-19) – what is known? Exp Ther Med. 2020;20(3):2344–7. https://doi.org/10.3892/etm.2020.8808Wu Y, Kang L, Guo Z, Liu J, Liu M, Liang W. Incubation Period of COVID-19 Caused by Unique SARS-CoV-2 Strains: A Systematic Review and Meta-analysis. JAMA Netw Open. 2022;5(8):e2228008. https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2022.28008Wu Y, Kang L, Guo Z, Liu J, Liu M, Liang W. Incubation Period of COVID-19 Caused by Unique SARS-CoV-2 Strains: A Systematic Review and Meta-analysis. JAMA Netw Open. 2022;5(8):e2228008. https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2022.28008Parums DV. Editorial: The XBB.1.5 ('Kraken') Subvariant of Omicron SARS-CoV-2 and its Rapid Global Spread. Med Sci Monit. 2023;29:e939580 https://doi.org/10.12659/MSM.939580Parums DV. Editorial: The XBB.1.5 ('Kraken') Subvariant of Omicron SARS-CoV-2 and its Rapid Global Spread. Med Sci Monit. 2023;29:e939580 https://doi.org/10.12659/MSM.939580Liu Z, Zheng H, Lin H, Li M, Yuan R, Peng J, et al. Identification of Common Deletions in the Spike Protein of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. J Virol. 2020;94(17):e00790-20. https://doi.org/10.1128/JVI.00790-20Liu Z, Zheng H, Lin H, Li M, Yuan R, Peng J, et al. Identification of Common Deletions in the Spike Protein of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. J Virol. 2020;94(17):e00790-20. https://doi.org/10.1128/JVI.00790-20Pernet O, Weisenhaus M, Stafylis C, Williams C, Campan M, Pettersson J, et al. Variant Study Group. SARS-CoV-2 viral variants can rapidly be identified for clinical decision making and population surveillance using a high-throughput digital droplet PCR assay. Sci Rep. 2023;13(1):7612. https://doi.org/10.1038/s41598-023-34188-7Pernet O, Weisenhaus M, Stafylis C, Williams C, Campan M, Pettersson J, et al. Variant Study Group. SARS-CoV-2 viral variants can rapidly be identified for clinical decision making and population surveillance using a high-throughput digital droplet PCR assay. Sci Rep. 2023;13(1):7612. https://doi.org/10.1038/s41598-023-34188-7Focosi D, Spezia PG, Maggi F. SARS-CoV-2 BA.2.86 ("Pirola"): Is it Pi or Just Another Omicron Sublineage? Vaccines (Basel). 2023;11(11):1634. https://doi.org/10.3390/vaccines11111634Focosi D, Spezia PG, Maggi F. SARS-CoV-2 BA.2.86 ("Pirola"): Is it Pi or Just Another Omicron Sublineage? Vaccines (Basel). 2023;11(11):1634. https://doi.org/10.3390/vaccines11111634Scarpa F, Sanna D, Benvenuto D, Borsetti A, Azzena I, Casu M, et al. Genetic and Structural Data on the SARS-CoV-2 Omicron BQ.1 Variant Reveal Its Low Potential for Epidemiological Expansion. Int J Mol Sci. 2022;23(23):15264. https://doi.org/10.3390/ijms232315264Scarpa F, Sanna D, Benvenuto D, Borsetti A, Azzena I, Casu M, et al. Genetic and Structural Data on the SARS-CoV-2 Omicron BQ.1 Variant Reveal Its Low Potential for Epidemiological Expansion. Int J Mol Sci. 2022;23(23):15264. https://doi.org/10.3390/ijms232315264Cobar O, Cobar S. What We Know about XBB. 1.16 (Arcturus) The Next Prevalent Variant of SARS-CoV-2. 2023 (Preprint). https://doi.org/10.13140/RG.2.2.25519.10409Cobar O, Cobar S. What We Know about XBB. 1.16 (Arcturus) The Next Prevalent Variant of SARS-CoV-2. 2023 (Preprint). https://doi.org/10.13140/RG.2.2.25519.10409Grein J, Ohmagari N, Shin D, Diaz G, Asperges E, Castagna A. Compassionate Use of Remdesivir for Patients with Severe Covid-19. N Engl J Med. 2020;382(24):2327–36. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2007016Grein J, Ohmagari N, Shin D, Diaz G, Asperges E, Castagna A. Compassionate Use of Remdesivir for Patients with Severe Covid-19. N Engl J Med. 2020;382(24):2327–36. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2007016Painter WP, Holman W, Bush JA, Almazedi F, Malik H, Eraut NCJE, et al. Human Safety, Tolerability, and Pharmacokinetics of Molnupiravir, a Novel Broad-Spectrum Oral Antiviral Agent with Activity against SARS-CoV-2. Antimicrob Agents Chemother. 2021;65(5):e02428-20. https://doi.org/10.1128/AAC.02428-20Painter WP, Holman W, Bush JA, Almazedi F, Malik H, Eraut NCJE, et al. Human Safety, Tolerability, and Pharmacokinetics of Molnupiravir, a Novel Broad-Spectrum Oral Antiviral Agent with Activity against SARS-CoV-2. Antimicrob Agents Chemother. 2021;65(5):e02428-20. https://doi.org/10.1128/AAC.02428-20Wahl A, Gralinski LE, Johnson CE, Yao W, Kovarova M, Dinnon KH. SARS-CoV-2 infection is effectively treated and prevented by EIDD-2801. Nature. 2021;591(7850):451–57. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03312-wWahl A, Gralinski LE, Johnson CE, Yao W, Kovarova M, Dinnon KH. SARS-CoV-2 infection is effectively treated and prevented by EIDD-2801. Nature. 2021;591(7850):451–57. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03312-wLi Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y, et al. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. N Engl J Med. 2020;382(13):1199–207. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001316Li Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y, et al. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. N Engl J Med. 2020;382(13):1199–207. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001316Riou J; Althaus CL. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020. Euro Surveill. 2020;25(4):2000058. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.4.2000058Riou J; Althaus CL. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020. Euro Surveill. 2020;25(4):2000058. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.4.2000058Wu JT, Leung K, Bushman M; Kishore N, Niehus R, de Salazar PM. Estimating clinical severity of COVID-19 from the transmission dynamics in Wuhan, China. Nat Med. 2020;26(4):506–10. https://doi.org/10.1038/s41591-020-0822-7Wu JT, Leung K, Bushman M; Kishore N, Niehus R, de Salazar PM. Estimating clinical severity of COVID-19 from the transmission dynamics in Wuhan, China. Nat Med. 2020;26(4):506–10. https://doi.org/10.1038/s41591-020-0822-7Sanches S, Lin YT, Xu C, Romero-Severson E, Hengartner N, Ke R. High Contagiousness and Rapid Spread of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. Emerg Infect Dis. 2020;26(7):1470–7. https://doi.org/10.3201/eid2607.200282Sanches S, Lin YT, Xu C, Romero-Severson E, Hengartner N, Ke R. High Contagiousness and Rapid Spread of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. Emerg Infect Dis. 2020;26(7):1470–7. https://doi.org/10.3201/eid2607.200282Singanayagam A, Hakki S, Dunning J, Madon KJ, Crone MA, Koycheva A, et al. Community transmission and viral load kinetics of the SARS-CoV-2 delta (B.1.617.2) variant in vaccinated and unvaccinated individuals in the UK: a prospective, longitudinal, cohort study. Lancet Infect Dis. 2022;22(2):183–95. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(21)00648-4Singanayagam A, Hakki S, Dunning J, Madon KJ, Crone MA, Koycheva A, et al. Community transmission and viral load kinetics of the SARS-CoV-2 delta (B.1.617.2) variant in vaccinated and unvaccinated individuals in the UK: a prospective, longitudinal, cohort study. Lancet Infect Dis. 2022;22(2):183–95. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(21)00648-4Satish S, Sylvia J, Vasna J, Prabakaran M. Scientometric Research Mapping of OMICRON for Scientific Production: A Global Perception Analysis. National Journal of Community Medicine. 2023;14:187–93. https://doi.org/10.55489/njcm.140320232593Satish S, Sylvia J, Vasna J, Prabakaran M. Scientometric Research Mapping of OMICRON for Scientific Production: A Global Perception Analysis. National Journal of Community Medicine. 2023;14:187–93. https://doi.org/10.55489/njcm.140320232593Shahhosseini N, Babuadze G, Wong G, Kobinger G. Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern. Microorganisms. 2021;9(5):926. https://doi.org/10.3390/microorganisms905092Shahhosseini N, Babuadze G, Wong G, Kobinger G. Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern. Microorganisms. 2021;9(5):926. https://doi.org/10.3390/microorganisms905092Abas AH, Marfuah S, Idroes R, Kusumawaty D, Fatimawali, Park MN, et al. Can the SARS-CoV-2 Omicron Variant Confer Natural Immunity against COVID-19? Molecules. 2022;27(7):2221. https://doi.org/10.3390/molecules27072221Abas AH, Marfuah S, Idroes R, Kusumawaty D, Fatimawali, Park MN, et al. Can the SARS-CoV-2 Omicron Variant Confer Natural Immunity against COVID-19? Molecules. 2022;27(7):2221. https://doi.org/10.3390/molecules27072221Viana R, Moyo S, Amoako DG, Tegally H, Scheepers C, Althaus CL, et al. Rapid epidemic expansion of the SARS-CoV-2 Omicron variant in southern Africa. Nature. 2022;603(7902):679–86. https://doi.org/10.1038/s41586-022-04411-yViana R, Moyo S, Amoako DG, Tegally H, Scheepers C, Althaus CL, et al. Rapid epidemic expansion of the SARS-CoV-2 Omicron variant in southern Africa. Nature. 2022;603(7902):679–86. https://doi.org/10.1038/s41586-022-04411-yParums DV. Editorial: The XBB.1.5 ('Kraken') Subvariant of Omicron SARS-CoV-2 and its Rapid Global Spread. Med Sci Monit. 2023;29:e939580. https://doi.org/10.12659/MSM.939580Parums DV. Editorial: The XBB.1.5 ('Kraken') Subvariant of Omicron SARS-CoV-2 and its Rapid Global Spread. Med Sci Monit. 2023;29:e939580. https://doi.org/10.12659/MSM.939580Gangavarapu K, Latif AA, Mullen JL, Alkuzweny M, Hufbauer E, Tsueng G, et al. Outbreak.info genomic reports: scalable and dynamic surveillance of SARS-CoV-2 variants and mutations. Nat Methods. 2023;20(4):512–22. https://doi.org/10.1038/s41592-023-01769-3Gangavarapu K, Latif AA, Mullen JL, Alkuzweny M, Hufbauer E, Tsueng G, et al. Outbreak.info genomic reports: scalable and dynamic surveillance of SARS-CoV-2 variants and mutations. Nat Methods. 2023;20(4):512–22. https://doi.org/10.1038/s41592-023-01769-3

The authors declare that there are no conflicts of interest present.